在国有划拨土地上自建房屋需依法申请并补缴费用。依据《中华人民共和国城市房地产管理法》，划拨土地上的住宅买卖需向政府申请，并办理出让手续，补缴土地出让价款及税费。未依法处理可能导致房屋无法合法交易，甚至面临拆除风险。
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划拨土地自建房需合规处理。具体操作：1.若需交易，先向有批准权的人民政府提出申请；2.办理土地使用权出让手续；3.补缴土地出让价款及税费；4.如不自住也不交易，确保遵守当地政府管理规定，避免违法使用。
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处理划拨土地上自建房，常见方式为申请政府批准并补缴费用。若房屋需交易，应先向政府申请，办理出让手续，并补缴相关税费。若不自住也不交易，应咨询当地政府了解具体管理要求。