对抚养权有争议的，不能通过协议离婚，只能通过诉讼离婚，并确定孩子的抚养权归属问题。夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
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可以起诉变更抚养权
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建议提起变更抚养权的诉讼，从根本上解决纠纷